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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR Agroécologie

NICOLAS Valérie

NICOLAS Valérie
Maître de conférences, Université de Bourgogne, UFR SVTE
Pôle : IPM
Equipe : signalisation cellulaire
Courriel : valerie.nicolas@inra.fr
Tel : 03.80.69.31.78
Fax: 03.80.69.37.53

Curriculum vitae

2008 : HDR University of Burgundy , Dijon
 1996 : Lecturer in Biochemistry and  Molecular Biology, University of Burgundy
 1995-1996 : Postdoctoral Position at INSERM U331, faculty of medicine RTH Laënnec,  Lyon, France
 1993-1995 : Postdoctoral Position at the Dept. of Biochemistry , CHUs Sherbrooke, Canada
 1993 : PhD Thesis in Molecular Genetic, University Claude Bernard, Lyon I

Activités de Recherche

In the past : eukaryotic translational  regulation,  homologous recombinaison, gene targeting, mammalian peroxisome functions, transcriptional regulation by  PPARalpha and HNF-4alpha nuclear receptors, transgenic mice development, fatty acids metabolism
 Now : role of histone deacetylase 2  in plant defence reactions. Structure-function studies of HD2s; HD2 gene regulation in relation with biotic and abiotic stresses. Identification of nuclear protein undergoing acetylation in response to plant cell death inducers. Nicotiana tabacum and Arabidopsis thaliana transformation

Activités d'enseignement

I was in charge of the first year of the master in “Biochemistry Molecular and Cellular Biology” of the University of Burgundy from 2003 to 2014.
 I teach Biochemistry and Molecular Biology in both the Bachelor and master study programmes :
 - general biochemistry (structure of lipids, proteins, sugars, and nucleic acids; molecular gene expression) (L1 level)
 - Molecular Biology (L3 BG, BCP, BO, BBM)
 - Methods in Molecular Biology (M1)
 - M2R, M2Pro Biotechnology, PhD managment

Mots clés

Molecular biology, gene expression regulation, translational and transcriptional mechanism, epigenetic modification

Publications

1- Trapet P., Kulik A., Lamotte O., Jeandroz S., Bourque S., Nicolas-Francès V., Rosnoblet C., Besson-Bard A. and Wendehenne  D. “NO signaling in plant immunity: a tale of messengers. Phytochemistry. “ 2014 112 : 72-79
 
 2- Nicolas-Francès V, Arnauld S, Kaminski J, Ver Loren van Themaat E, Clémencet MC, Chamouton J, Athias A, Grober J, Gresti J, Degrace P, Lagrost L, Latruffe N, Mandard S “ Disturbances in cholesterol, bile acid and glucose metabolism in peroxisomal 3-ketoacylCoA thiolase B deficient mice fed diets containing high or low fat contents” Biochimie, 2014 98:86-101
 
 3- Grandperret V, Nicolas-Francès V, Wendehenne D, Bourque S « Type-II histone deacetylases: elusive plant nuclear signal transducers. » Plant Cell Environ. 2014 37, 1259-1269
 
 4- Jeandroz S, Lamotte O, Astier J, Rasul S, Trapet P, Besson-Bard A, Bourque S, Nicolas-Francès V, Ma W, Berkowitz GA, Wendehenne D « There's more to the picture than meets the eye: nitric oxide cross talk with Ca2+ signaling. » Plant Physiol. 2013 163:459-70.
 
 5- Koen E., Lamotte O., Besson-Bard A., Bourque S., Nicolas-Francès V., Jeandroz S. and Wendehenne D. Le monoxyde d'azote, un acteur de l'immunité chez les plantes. Medecine Science 2013 29, 306-316.
 
 6- Fidaleo M., Arnauld S., Clémencet MC, Chevillard G, Royer MC, De Bruycker M, Wanders RJ, Athias A, Gresti J., Clouet P., Degrace P., Kersten S., Espeel M., Latruffe N., Nicolas-Francès V., Mandard S. “A role for the peroxysomal 3-ketoacyl-CoA thiolase B enzyme in the control of PPARalpha-mediated upregulation of SREBP-2 target genes in the liver” Biochimie. 2011 93:876-91
 
 7- Chamouton J., Hansmannel F., Bonzo JA, Clémencet M.C., Chevillard G., Battle M., Martin P., Pineau T., Duncan S., Gonzalez F.J., Latruffe N., Mandard S., Nicolas-Francès V. “The peroxisomal 3-keto-acyl-CoA thiolase B gene expression in under the dual control of PPARalpha and HNF-4alpha in the liver” PPAR res. 2010:352957.
 
 8- Arnauld S, Fidaleo M, Clémencet MC, Chevillard G, Athias A, Gresti J., Wanders RJ, Latruffe N., Nicolas-Francès V., Mandard S. “Modulation of the hepatic fatty acid pool in peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase B-null mice exposed to the selective PPARalpha agonist Wy14,643” Biochimie. 2009 91:1376-86
 
 9- Chevillard G, Clémencet MC, Etienne P, Martin P, Pineau T, Latruffe N, Nicolas-Francès V. "Molecular cloning, gene structure and expression profile of two mouse peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase genes.” BMC Biochem. 2004 5(1):3.
                                                      
 10- Chevillard G., Clémencet M.C., Latruffe N., Nicolas-Francès V. “Targeted disruption of the peroxisomal thiolase B gene in mouse: a new model to study disorders related to peroxisomal lipid metabolism”. Biochimie. 2004, 86:849-56.
 
 11- Desaint S, Hansmannel F, Clémencet MC, Le Jossic-Corcos C, Nicolas-Francès V, Latruffe N, Cherkaoui-Malki M. "NFY interacts with the promoter region of two genes involved in the rat peroxisomal fatty acid beta-oxidation: the multifunctional protein type 1 and the 3-ketoacyl-CoA B thiolase.” Lipids Health Dis. 2004, 3(1):4.
 
 12- Latruffe N., Nicolas-Francès V, Clémencet MC, Hansmannel F, Chevillard G, Etienne P., Le Jossic-Corcos C, Cherkaoui-Malki M. « Gene regulation of peroxisomal  enzymes by nutrients, hormones and nuclear signalling factors in animal and human species » Adv. Exp. Med. Biol. 2003, 544 : 225-236.
 
 13- Chevillard G, Clémencet MC, Etienne P, Martin P, Pineau T,  Latruffe N., Nicolas-Francès V. “ Tissue-specific expression of two peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase genes in wild and PPAR alpha-null mice and induction by fenofibrate. “Adv. Exp. Med. Biol. 2003, 544 : 55-56.
 
 14- Hansmannel F, Clémencet MC, Le Jossic-Corcos C, Osumi T, Latruffe N, Nicolas-Francès V. “Functional characterization of a peroxisome proliferator response-element located in the intron 3 of rat peroxisomal thiolase B gene.” Biochem Biophys Res Commun. 2003, 311, 149-55.
 
 15- Latruffe N, Cherkaoui-Malki M., Nicolas-Francès V., Jannin B., Clémencet MC., Hansmannel F., Passilly-Degrace P., Berlot J.P. “Peroxisome-proliferator-activated receptors as physiological sensors of fatty acids metabolism : molecular regulation in peroxisomes.” Biochem. Soc. Trans. 2001, 29, 305-309
 
 16- J.P. Berlot , T.Lutz, M.Cherkaoui Malki, V.Nicolas-Francès, B.Jannin et N.Latruffe : « Properties of a fluorescent Fibrate derivative (DNS-X) : liver peroxisome inducibility, subcellular distribution and PPARalpha activation »  Lipids 2000, 35, 1397-1404
 
 17- V.Nicolas-Francès, V.K.Dasari, E.Abruzzi, T.Osumi et N.Latruffe : « The peroxisome proliferator response element –681/-669 in the rat liver 3-ketoacyl-CoA thiolase B gene functionally interacts differently with PPARalpha and HNF-4alpha »  Biochem. Biophys.Res. Commun.  2000, 269, 347-351
 
 18- Latruffe N, Cherkaoui-Malki M., Nicolas-Francès V., Clémencet MC, Jannin B,  Berlot J.P. « Regulation of the peroxisomal beta-oxidation dependent pathway by peroxisome proliferator-alpha and kinases” Biochem. Pharmacol. 2000, 60, 1027-1032.
 
 19- Latruffe N, Nicolas-Francès V., Dasari V.K., Osumi T. « Studies on regulation of the peroxisomal beta-oxidation at the 3-ketothiolase step. Dissection of the rat liver thiolase B gene promoter” Adv. Exp. Med. Biol 1999, 466, 253-259
 
 20- V. Francès, M. Bastin : « Gene targeting in rat embryo fibroblasts promoted by the polyomavirus large T antigen » Nucleic Acids Research  1996, 24, 1999-2004
 
 21- S. Laurent, V. Francès, M. Bastin : « Intrachromosomal recombination mediated by the polyoma large T antigen » Virology, 1995, 206, 227-233. (IF=3.278)
 
 22- V. Francès, F. Morlé, J. Godet : «  Functional analysis of the 4 bp deletion identified in the 5’ untranslated region of one of the beta- globin genes of a chinese beta-thalassemic heterozygote » British Journal of Haematology, 1993, 84, 163-165.
 
 23- V. Francès, F. Morlé et J. Godet : « Identification of two critical base pairings in 5’ untranslated regions affecting translation efficiency of synthetic uncapped globin mRNAs » Biochimica Biophysica Acta, 1992, 1130, 29-37.

Principaux Contrats

Contrat d’étude Région Bourgogne transfert de technologie (2001-2003) ; Contrat européen “Peroxisomes LSHG-CT-2004-512018 ; Integrated Project to decipher the biological function of peroxisomes in health and disease”  (2004-2009) ; Contrat d’étude Région Bourgogne (2007-2009)

Liens externes