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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR Agroécologie

SPOR Aymé

SPOR Aymé
Chargé de Recherche
Pôle : BIOmE
Equipe/Thème : EMFEED
Courriel : ayme.spor@inra.fr
Tel : 03.80.69.30.94
Fax: 03.80.69.32.24

Curriculum Vitae

EXPÉRIENCES PROFESSIONNELLES

Depuis Octobre 2011 : Chargé de Recherche 2ème classe INRA, UMR1347 Agroécologie, F-21065 Dijon, France.
 Thème de recherche principal: Résistance et résilience des communautés microbiennes du sol impliquées dans le cycle de l’azote.
 
Jan 2010-Sept 2011 : Postdoctorant, Cornell University, Department of Microbiology
 Superviseur: Ruth E. Ley, Assistant Professor.
 Thème de recherche: Effets de l’environnement et du génotype de l’hôte sur l’assemblage du microbiome intestinal chez l’homme et de la rhizosphère chez le Maïs.
 
2006- 2009 : Doctorant, UMR 8120 Université Paris-Sud XI, Orsay, France
 Superviseurs: Delphine Sicard, Maitre de conférences & Dominique de Vienne, Professeur
 Thème de recherche: Evolution expérimentale et stratégies d’adaptation chez Saccharomyces cerevisiae

Activités de Recherche

Mes activités de recherche visent à caractériser les capacités de résistance et de résilience des écosystèmes microbiens terrestres face à des perturbations/stress répétés en relation avec le changement climatique comme les stress hydriques, thermiques et les pratiques agricoles (travail du sol, pesticides) et à en évaluer l’impact sur les services écosystémiques rendus par ces derniers (cycles biogéochimiques, productivité végétale). Il s’agit donc de relier des changements de diversité microbienne à des variations de niveau d’activité avec pour objectif de mieux comprendre le lien diversité – fonction et de prévoir la réponse des écosystèmes microbiens aux perturbations, et ce par différentes approches expérimentales et de modélisation.

Publications

  • Hussain S., Devers-Lamrani M., Spor A., Rouard N., Beguet J. & F. Martin-Laurent. Mapping field spatial distribution patterns of isoproturon mineralizing activity over a three years rape seed/winter wheat/barley rotation. (en révsion pour Chemosphere) 
  • Spor A.*, Kvitek D.*, Nidelet T., Martin J.,  Dillmann C. Bourgais A., de Vienne D., Sherlock G. & D. Sicard. Genotypic convergence underlies the convergence of multiple life-history traits during experimental evolution in different environments. (en révision pour Molecular Biology and Evolution)
  • Nidelet T., Spor A., Dillmann C., Sicard D. & O.C. Martin. Modeling competitions between Saccharomyces cerevisiae strains in batch culture: When time really matters. (en révision pour PLoS ONE)
  • Koren O., Goodrich J.K., Cullender T.C., Spor A., Laitinen K., Bäckhed H.K., Gonzalez A., Werner J.J., Angenent L.T., Knight R., Bäckhed F., Isolauri E., Salminen S. & R.E. Ley. (2012) Host remodeling of the gut microbiome and metabolic changes during pregnancy. Cell, 150(3): 1-11.
  • Hafeez F., Spor A., Breuil M.C., Schwartz C., Martin-Laurent F. & L. Philippot. (2012) Distribution of bacteria and nitrogen-cycling microbial communities along constructed Technosol depth-profiles. Journal of Hazardous Materials, 213-232: 88-97.
  • Ravussin Y.*, Koren O.*, Spor A., LeDuc C., Gutman R., Stombaugh J., Knight R., Ley R.E. & R. Leibel. (2012) Response of gut microbiotas to diet composition and weight loss in lean and obese mice. Obesity, 20(4):738-47.
  • Yilmaz P., Kottmann R., et al. (2011) Minimum Information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications. Nature Biotechnology, 29(5): 415-20.
  • Spor A.*, Koren O*. & R.E. Ley. (2011) Unraveling the effects of the environment and host genotype on the gut microbiome. Nature Reviews Microbiology, 9(4):279-90. 
  • Wang S., Spor A., Nidelet, T., Montalent, P., Dillmann C., de Vienne D., & D. Sicard. (2011) Switch between life-history strategies due to changes in glycolytic enzyme gene dosage in Saccharomyces cerevisiae. Applied and Environmental Microbiology, 77(2):452-9. 
  • Koren O.*, Spor A.*, Felin J.*, Fåk F., Stombaugh J., Tremaroli V., Behre C.J., Knight R., Fagerberg B., Ley R.E. & F. Bäckhed. (2011) Human oral and gut microbiota associated with atherosclerosis and cardio vascular disease. Proceedings of the National Academy of Science, USA, 15:108 Suppl 1:4592-8. 
  • Koenig J. E., Spor A., Fricker A. D., Scalfone N. B., Stombaugh J., Knight R., Angenent, L. T., & R. E. Ley. (2011) Succession of microbial consortia in the developing infant gut microbiome. Proceedings of the National Academy of Science, USA, 15:108 Suppl 1:4578-85. 
  • Spor A., Dillmann C., Wang S., de Vienne D., Sicard D., & E. Parent. (2010) Hierarchical Bayesian Modelling of Saccharomyces cerevisiae population dynamics. The International Journal of Food Microbiology, 142(1-2):25-35. 
  • Bataillon T., Dillmann C., Gaba S., Goldringer I., Kaltz O., Méry F., Nidelet T., Reboud X., Schneider D., Sicard D., Spor A. Evolution expérimentale. In : F. Thomas, T. Lefèvre et M. Raymond (Eds) Biologie Evolutive, De Boeck, collection LMD, France (2010).
  • Spor A., Nidelet T., Simon J., Bourgais A., de Vienne D., & D. Sicard. (2009) Niche-driven evolution of metabolic and life-history strategies in natural and domesticated populations of Saccharomyces cerevisiae. BMC Evol Biol, 9: 296. 
  • Spor A., Wang S., Dillmann C., de Vienne D. & D. Sicard. (2008). « Ant » and « Grasshoper » life-history strategies in Saccharomyces cerevisiae. PLoS ONE, 3(2):e1579. 
  • *These authors contributed equally to this work.

Mots clés

Cycle de l’azote, stabilité des communautés microbiennes du sol, fonctionnement des écosystèmes, perturbations

Principaux contrats

  • 2012-2016 : NORA: Nitrous oxide research alliance training network, UE project, 7th Framework, Marie Curie Initial Training Network
  • 2012-2015 : EFEMAIR-N2O: Effet sur les émissions de N2O des principaux leviers d’atténuation des impacts environnementaux : quantification, modélisation et rôle des communautés bactériennes, en systèmes de grande culture, ADEME REACCTIF
  • 2012-2015 : IMPEC: Développement d’indicateurs microbiens pour l’évaluation de l’impact des pesticides sur des fonctions écosystémiques terrestres et aquatiques, Programme MEED Pesticides – Ecophyto 2018
  • 2011-2015 : ECOFINDERS: Ecological Function and Biodiversity Indicators in European Soils, UE project, 7th Framework, Large scale integrated project