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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques des Ecosystèmes Limniques

UMR CARRTEL

Centre Alpin sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Lacustre

Proposition de CDD 6 mois / Niveau Ingénieur d'Etudes

Proposition de CDD 6 mois / Niveau Ingénieur d'Etudes
Niveau requis : Master 2 ou Ecole d’ingénieur - Bonnes connaissances en écologie aquatique

La plupart des travaux menés ces dernières années dans le domaine de la bio-indication en milieux lacustres (et plus largement sur les écosystèmes aquatiques) visent à développer des outils de caractérisation de l’état écologique en vue d’identifier les milieux dégradés à restaurer. Cependant ces bioindicateurs n’offrent qu’une vision partielle de la biodiversité qui supporte le fonctionnement des milieux aquatiques et ils ne concernent pas certains compartiments biologiques pourtant importants d’un point de vue fonctionnel. C’est le cas par exemple des organismes de petite taille comprise entre 0,2 et 2-3 µm qui constituent le picoplancton, très largement ignoré et jouant pourtant un rôle très important au sein des réseaux trophiques comme producteurs primaires, recycleurs de la matière ou encore comme proies pour les maillons trophiques supérieurs.  

Le projet vise l’objectif d’initier un travail d’analyse sur la possibilité d’utiliser le picophytoplancton (c'est-à-dire la fraction végétale du picoplancton comme marqueur des changements naturels ou anthropiques en lac (changements climatiques globaux, accroissement de la dose des ultraviolets dans les eaux de surface, eutrophisation des milieux grandissante), ou de trajectoire de restauration de ces écosystèmes.

Une application très attendue de cette partie du projet est de déterminer comment cette composante du phytoplancton, encore non considérée, devrait être incluse à l’avenir comme un nouveau bio-indicateur d’état, fonctionnel et prédictif des écosystèmes. On s’intéressera en particulier aux picocyanobactéries, en termes d’abondances, de biomasse relative à l’ensemble du phytoplancton, de diversité pigmentaire et génétique, et de proies pour les maillons trophiques supérieurs.

La durée du projet ne permettra pas d’apporter des éléments de réponse à l’ensemble des questions après seulement 6 mois de travail. Néanmoins, plusieurs tâches seront proposées :

-              Analyse de la littérature ;

-              Analyse des abondances et biomasse des picocyanobactéries comparativement à celles du phytoplancton dans son ensemble sur quelques échantillons prélevées sur une variété de lacs ;

-              Analyse pigmentaire et première approche génétique (sous réserve de temps disponible).

In fine, l’ensemble de ces analyses devrait permettre de :

-              vérifier la présence et l’importance quantitative des picocyanobactéries et de certains sous-groupes sur des critères pigmentaires ;

-              tester le lien entre abondance et/ou biomasse absolue et relative (vis-à-vis du phytoplancton dans son ensemble) et les paramètres trophiques (ou autres) mesurés ;

-              justifier le démarrage d’une thèse sur le sujet.

 

 

Responsable : Stéphan Jacquet (stephan.jacquet[at]inra.fr)

Mots-clés : Lac, picoplancton, bio-indication

Laboratoire d’accueil et lieu du CDD : UMR CARRTEL INRA – USMB, 75 bis, avenue de Corzent, F-74203 Thonon-les-Bains cedex - France

Niveau requis : Master 2 ou Ecole d’ingénieur - Bonnes connaissances en écologie aquatique. Durée: 6 mois

Qualités requises : Autonomie, aptitude à faire du terrain, intérêt pour l’analyse des données.

Conditions d’accueil : Salaire selon expérience (minimum de 2020 euros brut mensuels)- Accès à la cantine de l'établissement

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