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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques des Ecosystèmes Limniques

UMR CARRTEL

Centre Alpin sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Lacustre

RIMET Frédéric

Frédéric Rimet
Ingénieur d'études

 

Tél. : +33 (0)4 50 26 78 74
Fax : +33 (0)4 50 26 07 60
Mail : frederic.rimet[at]inra.fr

Plateau technique

Laboratoire de biodiversité et de biologie moléculaire

Thématique(s) de recherche

Phycologie, bioindication, taxonomie, phylogénie, écologie, écotoxicologie, paléolimnologie

Parcours professionnel

Du 1-12-2004 au 31-10-2007 : Diren Lorraine (Metz), titulaire du poste d’hydrobiologiste
Du 1-3-2000 au 11-2004 : Centre de Recherche Public – Gabriel Lippmann (Luxembourg), Chercheur en algologie (diatomées)
Du 1-10-1999 au 31-12-1999 : Diren Rhône-Alpes (Lyon), Hydrobiologiste (diatomées)

Formation initiale et formation(s) caractéristique(s)

2012 - Thèse « Diatoms: an ecoregional indicator of nutrients, organic matter and micropollutants pollution »D

DESS « Eaux continentales pollutions et aménagements » (Besançon)

Enseignement(s) dispensé(s)

MASTER 2 Besançon : Diatomées d’eau douce : biologie, écologie bioindication et directive cadre

Publication(s) récente(s)

Stubbington R, Paillex A, England J, Barthès A, Bouchez A, Rimet F, Sánchez-Montoya MM, Westwood CG, Datry T, 2019. A comparison of biotic groups as dry-phase indicators of ecological quality in intermittent rivers and ephemeral streams. Ecological Indicators 97, 165–174.

Keck, F., Vasselon, V., Rimet, F., Bouchez, A., Kahlert, M., 2018. Boosting DNA metabarcoding for biomonitoring with phylogenetic estimation of operational taxonomic units’ ecological profiles. Molecular Ecology Ressources, 1-11. DOI: 10.1111/1755-0998.12919

Esteves S. M., Almeida S. F. P., Gonçalves S., Rimet F., Bouchez A., Figueira E., 2018. Sensitive vs. tolerant Nitzschia palea (Kützing) W. Smith strains to atrazine: a biochemical perspective. Ecotoxicology, https://doi.org/10.1007/s10646-018-1953-1

Lefrançois, E., Apothéloz-Perret-Gentil, L., Blancher, P., Botreau, S., Chardon, C., Crepin, L., Cordier T., Cordonier A., Domaizon I., Ferrari B.J.D., Guéguen J., Hustache J.C., Jacas L., Jacquet S., Lacroix S., Mazenq A.L., Pawlowska A., Perney P., Pawlowski J., Rimet F., Rubin J.F., Trevisan D., Vivien R., Bouchez A., (2018). Development and implementation of eco-genomic tools for aquatic ecosystem biomonitoring: the SYNAQUA French-Swiss program. Environmental Science and Pollution Research, 1–9. doi:10.1007/s11356-018-2172-2

Jan Pawlowski, Mary Kelly-Quinn, Florian Altermatt, Laure Apothéloz-Perret-Gentil, Pedro Beja, Angela Boggero, Angel Borja, Agnès Bouchez, Tristan Cordier, Isabelle Domaizon, Maria Joao Feio, Ana Filipa Filipe, Riccardo Fornaroli, Wolfram Graf, Jelger Herder, Berry van der Hoorn, J. Iwan Jones, Marketa Sagova-Mareckova, Christian Moritz, Jose Barquín, Jeremy J. Piggott, Maurizio Pinna, Frederic Rimet, Buki Rinkevich, Carla Sousa-Santos, Valeria Specchia, Rosa Trobajo, Valentin Vasselon, Simon Vitecek, Jonas Zimmerman, Alexander Weigand, y, Florian Leese, Maria Kahlert ( 2018) The future of biotic indices in the ecogenomic era: Integrating (e)DNA metabarcoding in biological assessment of aquatic ecosystems. Science of The Total Environment 637–638, 1295–1310.

Rimet F, Druart J-C. 2018. A trait database for Phytoplankton of temperate lakes. Ann. Limnol. - Int. J. Lim. 54: 18. https://doi.org/10.1051/limn/2018009

Mougin, C., Artige, E., Marchand, F., Mondy, S., Ratié, C., Sellier, N., Castagnone, P., Coeur D'Acier, A., Esmenjaud, D., Faivre-Primot, C., Granjon, L., Hamelet, V., Lange, F., Pages, S., Rimet, F., Ris, N., Salle, G. (2018). BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for research in environmental and agricultural sciences. Environmental Science and Pollution Research. DOI : 10.1007/s11356-018-1973-7

Rivera S., Vasselon V., Ballorain K., Carpentier A., Wetzel C., Ector L., Bouchez A., Rimet F., 2018. DNA Metabarcoding and Microscopic Analyses of Sea Turtles Biofilms: Complementary to Understand Turtle Behavior. PLOS ONE 13(4): e0195770. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0195770

Rimet F., Abarca N., Bouchez A., Kusber W.H., Jahn R., Kahlert M., Keck F., Kelly M.G., Mann D.G., Piuz A., Trobajo R., Tapolczai K., Vasselon V., Zimmermann J., 2018. The potential of High-Throughput Sequencing (HTS) of natural samples as a source of primary taxonomic information for reference libraries of diatom barcodes. Fottea, Olomouc, 18(1): 37–54. DOI: 10.5507/fot.2017.013

Rimet F., Vasselon V., A.-Keszte B., Bouchez A., 2018. Do we similarly assess diversity with microscopy and high-throughput sequencing? Case of microalgae in lakes. Organisms Diversity & Evolution. 18: 51–62. DOI: 10.1007/s13127-018-0359-5

Vasselon V., Bouchez A., Rimet F., Jacquet S., Trobajo R., Corniquel M., Tapolczai K., Domaizon I., 2018. Avoiding quantification bias in metabarcoding: Application of a cell biovolume correction factor in diatom molecular biomonitoring. Methods in Ecology and Evolution, 2018: 1-10. DOI: 10.1111/2041-210X.12960

Frossard V., Rimet F., Perga M.E., 2018. Causal networks reveal the dominance of bottom-up interactions in large, deep lakes. Ecological Modelling 368: 136–146. https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2017.11.021

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