Phénotypage Haut-Débit

Phénotypage Haut-Débit

La zone de dédiée au phénotypage Haut Débit est entièrement équipée de convoyeurs et comprend :

Culture de précision automatisée

Controlled irrigation

Le système d'irrigation est composé de perches rétractables avec canules d'arrosage ; plusieurs configurations permettent de s'adapter aux différents types de contenants (pots , RhizoTubes).
Des balances assurent des pesées avant et après arrosages, toutes les données sont enregistrées.
Pour les RhizoTubes des postes de pesées avec drainages sont présents afin d’évacuer la solution nutritive excédentaire. 


 

 

Caractérisation du climat

Capteurs climatiques

La 4PMI dispose de plus de 80 capteurs climatiques répartis sur l'ensemble des serres automatisées. Plusieurs variables climatiques sont mesurées : la température (ventilée au niveau du couvert), la lumière incidente (PAR) ou encore l'humidité relative. 
Ces données sont enregistrées en temps réel et son accessibles via des interfaces "utilisateurs" spécifiquement développées.

Phénotypage des parties aériennes et des racines

la prise d'images automatisée des parties aériennes et des systèmes racinaires réalisée à l'aide de caméra haute définition.

  • Phénotypage aérien

Les contenants de culture (pots ou RhizoTubes) sont acheminés via des convoyeurs dans les cabines de phénotypage. 3 cabines sont dédiées au phénotypage aérien, chacune d'elle est équipée d'une caméra spécifique (visible, NIR, fluorescence). Pour chaque contenant  le système acquière 12 images latérales (rotation tous les 30°) et une sommitale.

 

  • Phénotypage racinaire

2 systèmes de prise d'image sont disponibles, le premier est  bas débit et très haute définition, et un second haut débit et haute définition

IMG_0854_RhizoCab_v2

La RhizoCab® HR (haute résolution), permet le phénotypage du système racinaire des plantes cultivées en RhizoTube®. La précision est paramétrable et peut aller jusqu’à 3600 dpi (1pixel = 7 microns). Les acquisitions sont réalisées dans trois longueurs d'onde (465, 525, 625 nm). Un mode zoom permet de suivre des zones d’intérêt.

 

 

 

Une deuxième cabine  nommée RhizoCab® HD (haut débit)) est également dédiée au phénotypage racinaire. elle reprend le même principe de fonctionnement que la RhizoCab® HR, mais est montée sur convoyeur.

 

 

 

Les images obtenues sont analysées afin de mesurer différents paramètres morphométriques des parties aériennes et racinaires telles que la surface projetée, la hauteur et largeur, la surface de prospection, longueur et diamètres racinaires.

phenotypage_aerien_original_rgb
phenotypage_aerien_surface_projetee
phenotypage_aerien_boite_englobante
phenotypage_aerien_enveloppe_convexe
phenotypage_racinaire_original_rgb

Photo originale couleur

phenotypage_racinaire_surface_projetee

Surface projetée

phenotypage_racinaire_boite_englobante

Hauteur (Profondeur) et Largeur

phenotypage_racinaire_enveloppe_convexe

Surface de prospection

phenotypage_racinaire_sk

Longueurs cumulées

Date de modification : 20 juillet 2023 | Date de création : 12 août 2019 | Rédaction : admin